Она способна в автоматическом режиме анализировать геномы разных штаммов бактерий, пишет iz.ru.
Новое программное обеспечение выявляет одинаковые мутации у возбудителей инфекций.
По словам аспиранта факультета информационных технологий и программирования ИТМО Алексея Забелкина, его коллеги приняли решение создать алгоритм, который сможет сравнивать геномы бактерий и находить в них параллельные эволюционные изменения.
Так называются одинаковые изменения в наборе и последовательности генов организмов одного вида, которые произошли независимо друг от друга. Единичная мутация может произойти случайно. Однако случайность исключена, если не связанные между собой параллельные вариации отражают закономерные эволюционные механизмы адаптации. Когда ученые поймут данные процессы, они смогут более эффективно лечить инфекционные заболевания, вызванные бактериями.
Специалисты проверили эффективность своей программы во время анализа эволюционных изменений в 200 штаммах стрептококка. Со временем их разработка станет использоваться при анализе эволюции любых бактерий.
Ученые планируют увеличить функционал программы. Это нужно для выявления изменений генома, наделившего бактерии теми или иными свойствами. Наиболее часто новый подход станут применять при изучении бактерий, которые вызывают у людей инфекции. Так удастся установить причины их болезнетворности.