Глава клана Мустафа Батдыев занял пост президента в 2003 году. Тогда Батдыев работал председателем Национального банка КЧР и имел хорошие связи в федеральном центре. Еще в девяностых годах, будучи вице-премьером правительства республики, Батдыев, по данным СМИ, отвечал за приватизацию и с тех пор имел репутацию «карачаевского Чубайса». Сам Анатолий Чубайс (на тот момент глава РАО ЕЭС России), по данным СМИ, прибыл на инаугурацию Батдыева в Черкесске в сентябре 2003 года. Кроме того, «правая рука» Чубайса на Северном Кавказе – Магомед Каитов, много лет возглавлявший МРСК Северного Кавказа, - также был выходцем из круга Мустафы Батдыева, его племянник Алий Каитов доводился президенту КЧР зятем.
Через несколько месяцев в Карачаево-Черкесии возник новый кризис власти, так как в октябре 2004 года произошло массовое убийство. Жертвами стали 7 человек во главе с местным бизнесменом Расулом Богатыревым. Поводом для этого преступления стала борьба за контроль над крупным химическим комбинатом, в которой Богатырев схлестнулся с Алием Каитовым, на тот момент возглавлявшим совет директоров еще одного крупного предприятия республики – завода «Кавказцемент».